長崎歴史文化博物館は、長崎県と長崎市が共同で設置した、「近世長崎の海外交流史」をテーマとする博物館。2005年開館。
江戸幕府の鎖国政策中に西洋と貿易を行っていたり、朝鮮通信使を迎え入れていたりと、海外に開かれていた長崎ならではの、近世海外交流の歴史や文化を紹介する。常設展示では、朱印船貿易家の遺品や、出島に来航したオランダ船などの模型、異国情緒あふれる長崎の美術工芸品、シーボルトの手術道具などを展示している他、長崎奉行所の一部が復元・公開されている。体験コーナーや映像コンテンツも充実している。