とある日、すみっコたちは森のはずれで古くなった建物を見つける。そこはおもちゃを作る工場だった。「いっしょに作ってみよう！」手先が器用なしろくまはミシン、ぺんぎん？は虫めがねでけんぴんなど、それぞれとくいなことを活かしておもちゃ作りをスタート。でも、なんだかその工場にはふしぎなところがあって・・・？

『映画 すみっコぐらし ツギハギ工場のふしぎなコ』は、劇場版アニメ『映画 すみっコぐらし』シリーズ第3弾。「すみっこにいると、なぜか落ち着く。」というちょっぴりネガティブだけど個性的なキャラクターの「すみっコぐらし」が、森の中の工場を舞台に物語を繰り広げる。第1弾の『映画 すみっコぐらし とびだす絵本とひみつのコ』、そして第2弾『映画 すみっコぐらし 青い月夜のまほうのコ』に続き、ナレーションを井ノ原快彦、本上まなみが続投。